5月20日，据日本共同社报道，日本高中棒球联盟于20日线上召开第102届全国高中棒球锦标赛运营委员会会议，决定取消原定8月10日起的夏季甲子园大赛。随后召开的理事会会议发表了正式决定。这是夏季甲子园大赛史上第三次、战后第一次被取消，春季的选拔赛和夏季甲子园大赛连续取消则为史上首次。
此前，日本高中棒球联盟讨论过空场比赛等方案，但由于部分地区无法确定复课后何时重启社团活动，争夺甲子园大赛入场券的地方大赛无法统一举行。此外，全国大赛举行时，也存在交通及住宿造成的感染风险，因此联盟最终决定取消甲子园大赛。
此外，原定与夏季甲子园大赛同时期举行的“全国高中综合体育大会”已在4月26日决定取消。而日本体育界受疫情影响较大：3月27日，B联赛宣布取消剩余所有赛事，提前结束赛季；J联赛取消升降级制度，并在4月底，创立以来首次向金融机构申请融资；5月21日，路透社报道，IOC主席巴赫认为若2021年东京奥运会仍受疫情影响无法举行，将必须取消，但被东京奥组委CEO武藤敏郎反驳。
5月13日，日本关西大学名誉教授宫本胜浩（理论经济学）公布估算数据称，受新型冠状病毒肺炎疫情蔓延影响，在今年初到6月底期间，职业棒球和职业足球J联赛等国内职业体育界的经济损失达到约2747亿日元。
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